Die Mitarbeiter am IfB sind in vier Arbeitsbereichen tätig. Drei Arbeitsbereiche konzentrieren sich auf die anwendungsorientierte Fischereiforschung, Arbeitsbereich 4 ist für die Ablauforganisation, Verwaltung und Infrastruktur verantwortlich. Eine Übersicht zu den derzeitigen Forschungsaktivitäten ist auch dem aktuellen IfB-Jahresbericht zu entnehmen.