Die Mitarbeiter am IfB sind in fünf Arbeitsbereichen tätig. Vier Arbeitsbereiche konzentrieren sich auf die anwendungsorientierte Fischereiforschung, Arbeitsbereich 5 ist für die Ablauforganisation, Verwaltung und Infrastruktur verantwortlich. Eine Übersicht zu den derzeitigen Forschungsaktivitäten ist auch dem aktuellen IfB-Jahresbericht zu entnehmen.